無人船系統由無人船體、遙控器、地面基站、微型定位系統、船載儀器和地面站軟件組成。操作員可用遙控器對無人船進行手動控制；也可以通過地面站設置無人船進行自動駕駛。在航行的同時，自動采集江河湖庫等地表水體的水質數據、水面視頻圖像和無人船狀态信息。測試數據同步上傳到到的便攜電腦上運行的“無人船走航分析軟件”中進行分析計算。